Der Begriff "Diakonie" (griechisch: diakoneo) bedeutet ursprünglich "bei Tisch dienen", im weiteren Sinne: "fürsorgend jemandem helfen, dienen". Diakonie umfasst Verkündigungsdienst wie den karitativen Dienst in der Kirchengemeinde und darüber hinaus.
Für die soziale Arbeit der evangelischen Kirche sind im Kirchenkreis Gotha das Diakoniewerk Gotha und der Bodelschwingh-Hof Mechterstädt engagiert. Beide Vereine arbeiten eng verflochten zusammen und die Leitungsgremien kooperieren. Vorsitzender des 1847 als Arbeitsanstalt für Bedürftige gegründeten Diakoniewerks Gotha ist der Superintendent des Kirchenkreises.
